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Para instalar um ambiente virtual  para programação em Python 3 no c9, criei 2 scripts:

• install-01.sh
• install-02.sh:

install-01.sh:

#! /bin/bash

#Baixando Miniconda 64Bits para Linux
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

#Mudando permissões para execução
chmod a+x Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

#Executando 
./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

# Aceite tudo que pedir

# Feche o terminal e abra novamente.
echo 'execute o install02.sh'

install-02.sh:

#! /bin/bash

# Criando um ambiente (sand box instance)
conda create -n py3 python=3 ipython

# Ativando o ambiente criado
source activate py3

# Instalar o Gerenciador de pacotes pip
conda install pip

# Na instalacao instale os pacotes
#pip install numpy
#pip install pandas
#pip install matplotlib

# qual ipython vai ser usado no ambiente? pip freeze mostra
pip freeze

# Instalando ipython notebook
conda install ipython-notebook

# Installing the packages
conda install numpy
conda install pandas
conda install matplotlib

I have installed more than only pandas, as you can see in the script you can install any package using conda install package_name